Tarmpatogene bakterier og virus, DNA/RNA

Indikasjon:

Gastroenteritt og enterokolitt utredning.

Metode og agens:

Påvisning av tarmpatogene bakterier og virus utføres nå med en bred PCR-basert diagnostikk der analyse for 12 ulike agens utføres rutinemessig. Endring av diagnostikken til en primær screening ved bruk av genteknologisk metode (PCR) vil gi raskere svar og økt sensitivitet for flere agens.

Analysepakken «Tarmpatogene bakterier og virus, DNA/RNA» inneholder analyser for:

Bakterier Virus
Campylobacter Norovirus genogruppe l og ll
Salmonella Sapovirus genogruppe l,ll, lV og V
Shigella/EIEC (Enteroinvasiv E. coli) Adenovirus serotype 40,41
Yersinia Rotavirus Gruppe A
EHEC (Enterohemoragisk E. coli) Astrovirus genotype 1-8
ETEC (Enterotoxigen E. coli)

 

Ved positiv funn med PCR-analysen vil aktuelle bakterie(r) bli forsøkt dyrket.

For alle mikrobiologiske undersøkelser som rekvireres er det viktig med relevante kliniske opplysninger. Ved kliniske opplysninger om diaré etter inntak av sjømat eller opphold i tropiske områder, vil laboratoriet utføre spesialdyrkning for Aeromonas, Plesiomonas og Vibrio.

Prøvemateriale:

Fæces

Prøvetakingsutstyr:

_MG_1157

Link for å laste ned prøvetakingsveiledning for fecalSwab:

http://www.unilabs.no/Global/_NO/Dokumenter/Diverse%20Telelab/Bruksanvisning%20pr%C3%B8vetakning%20fecalSwab.pdf

Samtlige analyser utføres på fæces tilsendt på Copan fecalSwab (Cairy-Blair transportmedium). Dersom pasienten tar flere prøver til ulike tidspunkt, må hver prøve merkes med prøvetakingstidspunkt. Ved behov for repeterte prøver anbefales det at prøvene tas på ulike dager.

Oppbevaring og forsendelse:

Prøver anbefales oppbevart i kjøleskap før forsendelse. Transporttiden bør ikke overskride 3 døgn, dette av hensyn til overlevelsen av bakterier for evt. dyrkning.

Prøven pakkes i transporthylse og ferdig merket prøvepose/konvolutt.

Svartid:

PCR analyser: 1-3 dager.

PCR + bakteriologisk dyrkning: 2-5 dager avhengig av agens

Analysene utføres på hverdager, mandag – fredag.

 

Besvarelse/tolkning:

Negative PCR analyser besvares med «Ikke påvist»

Positive virus PCR analyser besvares med «Påvist»

Positive bakterie PCR analyser besvares med «Påvist» , dyrkning forsøkes og dyrkningsanalysen besvares med agens navn når ferdig.

Positive bakteriefunn ringes til rekvirenten.

Førstegangspåvisning av Salmonella, Shigella/EIEC, EHEC, ETEC, Campylobacter og Yersinia er nominativ meldepliktig.

Alle Salmonella, Shigella/EIEC, EHEC og Yersinia stammer sendes referanselaboratoriet ved FHI. Når svaret på referanseundersøkelsen foreligger, vil det sendes ut et nytt svarbrev.

 

Kontrollprøver:

Kontrollprøver, etter tidligere påvist tarmpatogene bakterie(r), vil kun bli dyrket. PCR analysen  skiller ikke mellom døde og levende bakterier. Det er viktig å informere laboratoriet om hvilken agens som ønskes kontrollert.

For veiledning i kontroll og oppfølging av pasienter med tarminfeksjoner se kapittel 19 i Smittevernvernveilederen, FHI.

 

 

 

 

Stikkord: , , , , , , , , , , , , , , , ,